2020年7月27日消息，近日，Daniel D. De Carvalho和Gelareh Zadeh在Nature Medicine发表研究 Detection and discrimination of intracranial tumors using plasma cell-free DNA methylomes，开发了一种利用cfMeDIP-seq进行颅内肿瘤诊断和分型的非侵入式检测方法。

       由于血脑屏障的存在，ctDNA可能无法进入血液，因此首先需要检验脑癌患者的血液中是否存在ctDNA。在60例神经胶质瘤患者的血浆中，研究者检测到了ctDNA，并且这些ctDNA的甲基化位点与脑癌组织的DNA甲基化非常相似，说明ctDNA确实来自颅内癌组织。同时，这些甲基化位点明显区别于其他肿瘤，这提示ctDNA的甲基化可作为神经胶质瘤的筛查。

       颅内肿瘤分型多，预后也差别大，而研究者发现cfMeDIP-seq可以有效的区分在核磁共振中看起来非常相似但实际上却是不同分型的颅内肿瘤，这说明ctDNA的甲基化检测能应用于颅内肿瘤的分型。

       总的来说，该研究首次提出利用cfMeDIP-seq进行的ctDNA甲基化的检测可用于颅内脑癌的诊断和分型。这种方法可以准确的将颅内肿瘤与可能转移至大脑的颅外肿瘤和健康对照进行区分，并判断这些原发性颅内肿瘤的具体分型，为临床治疗方案的设计提供重要参考。

       研究背景

       颅内肿瘤，也称为脑癌，包括颅内各种组织的原发性肿瘤和身体其他部位转移到颅内的继发性肿瘤。由于仅从影像检测上无法准确地判断颅内肿瘤的病变程度（良性肿瘤或高侵袭性肿瘤），目前的检测需要采用侵入式神经外科手术以获得用于诊断和分型的组织样品，而这会引入神经损伤的风险。因此，非侵入式检测在颅内肿瘤的诊断中具有重要意义。

       检测患者血液的肿瘤游离DNA(cell-free tumor DNA, ctDNA)已成为肿瘤诊断的重要手段，在肺癌等肿瘤中有很好的应用前景。但是，ctDNA的基因组分析灵敏度有限，这是由于ctDNA在血液中的含量较低】，并且用于有效区分正常组织和癌组织的差异较少。因此，需开发灵敏度更高，更特异的非侵入式检查手段。

       2018年，来自加拿大多伦多大学的Rayjean J. Hung和Daniel D. De Carvalho开发了一种分离和检测ctDNA甲基化水平的技术，即“游离DNA甲基化免疫共沉淀测序”（cell-free methylated DNA immunoprecipitation and high-throughput sequencing，cfMeDIP-seq），用于胰腺癌，结肠癌和乳腺癌等的非侵入式检测。