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了解国产数字PCR仪和展望其未来发展
时间:2019-04-24 08:47  浏览:1438
   数字PCR简介

  数字PCR作为第三代PCR技术,是将分子生物学与现代微机电、微纳制造等工程技术相结合的典范。数字PCR以聚合酶链式反应的理论和技术体系为基础,结合现代微机电和光学检测技术,实现单分子水平的核酸精确定量检测。该技术的诞生和发展为核酸精确测定和基因分析提供了全新的思路,并具有比传统实时荧光定量PCR技术更好的精确性和灵敏度。

  在定量PCR时,我们常常纠结一个问题,究竟是相对定量还是绝对定量呢?如今,你无需纠结了,因为数字PCR(digitalPCR)来了。尽管这两种技术有些类似,都是估计起始样品中的核酸量,但它们有一个重要的区别。定量PCR是依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,而数字PCR则让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的绝对定量。因此特别适用于依靠Ct值不能很好分辨的应用领域:拷贝数变异、突变检测、基因相对表达研究(如等位基因不平衡表达)、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等。PCR技术发展史

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  20世纪末,Vogelstein等提出数字PCR(digitalPCR,dPCR)的概念,通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同的反应单元,每个单元至少包含一个拷贝的目标分子(DNA模板),在每个反应单元中分别对目标分子进行PCR扩增,扩增结束后对各个反应单元的荧光信号进行统计学分析。

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  数字PCR技术不断发展,Bio-Rad、LIFETechnologies及RainDance等厂家相继推出技术较为成熟的数字PCR产品。

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  QuantaLife公司开发出的微滴数字PCR技术。该产品还获得了2011年度Frost&Sullivan北美新产品创新奖。2011年10月,Bio-Rad公司收购了QuantaLife和ddPCR技术,相继推出了QX100、QX200微滴式数字PCR系统。

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  与其他数字PCR技术不同,Bio-Rad对样品进行微滴化处理。据该公司基因表达部门的销售经理RichardKurtz介绍,他们的独特优势是能够产生非常均一、重复的1纳升液滴。这样的好处是每个样品形成20,000个液滴,而其他系统只能分成760-3,000个部分。分得越多,则意味着分析越准确。

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  数字PCR是一种核酸分子绝对定量技术。当前核酸分子的定量有三种方法,光度法基于核酸分子的吸光度来定量;实时荧光定量PCR(RealTimePCR)基于Ct值,Ct值就是指可以检测到荧光值对应的循环数;数字PCR是最新的定量技术,基于单分子PCR方法来进行计数的核酸定量,是一种绝对定量的方法。主要采用当前分析化学热门研究领域的微流控或微滴化方法,将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。

  PCR原理

  PCR实际上是一个在模板DNA、引物(模板片段两端的已知序列)和四种脱氧核苷酸等存在的情况下,DNA聚合酶依赖的酶促合成反应,扩增的特异性取决于引物与模板DNA的特异结合。

  微滴式数字PCR仪

  MarketsandMarkets在2017年6月发布研究报告,对2017年~2022年定量PCR和数字PCR市场进行了分析和预测。分析指出,全球定量PCR和数字PCR市场将以8.9%的年复合增长率增长,到2022年将达到53.1亿美元,市场前景无疑是很具有吸引力的。

  但数字PCR目前在科研和临床的应用还比较初步,数字PCR市场规模仅占到荧光定量PCR仪的1/10,且主流产品多为欧美跨国公司的高端仪器

  国产数字PCR仪的机会在哪里?

  技术壁垒高、国产品牌起步晚,国产数字PCR仪的机会在哪里?仪器信息网邀请到锐讯生物市场总监徐亚骏、新羿生物副总裁杨文军、臻准生物联合创始人兼CEO郭枫三位国产数字PCR企业高管,就这一话题展开讨论。

  专业人士探讨

  徐亚骏:国家“进口替代”的政策导向是对数字PCR研发的大力支持。

  进口替代一直是国家鼓励的思路。国家在药品的替代上已经执行很久并且有成熟的扶持政策和导向,下一步就是医疗器械。目前,在精准医疗领域,国内绝大多数企业都耗巨资购买国外的设备和试剂耗材。纵观过去几年热热闹闹的精准医疗行业,最大的获利者其实是像Illumina,ThermoFisher这样的国外上游设备供应商。所以国家支持国产自主知识产权的上游设备研发的决心是坚定的。

  国产数字PCR仪的机会和潜力巨大,同时也是大势所趋,跟当年荧光定量PCR仪由进口到国产替代的路径很类似。具有硬核研发实力的原创型科技公司才能占据市场竞争主动权。目前低端设备的国产替代进展很快,企业、高校和医院实验室里低端设备已经完成大比例的国产替代。高端设备目前仍然以进口产品为主,国产替代和自主研发是趋势也是刚需。

  杨文军:机会在于技术创新+国内产业优势+数字PCR应用的普及。

  虽然数字PCR市场现在基本上还是被国际大品牌所占有,国产数字PCR仪将会有很多机会。

  首先,通过技术创新规避了现有成熟品牌目前所有的缺陷,在样本制备、芯片设计、数据采集等各方面有较大的性能提高;其次,利用国内的产业制造优势,仪器、芯片、耗材成本大大降低,使得数字PCR仪进入临床应用具备了经济可行性;另外,一些优秀的国内数字PCR厂商,比如新羿生物,在完全自主知识产权数字PCR系统基础上,大力开发肿瘤液体活检、无创产前筛查、感染性疾病早期诊断等领域的诊断试剂盒,这将迅速推动数字PCR的应用和普及。

  国产仪器比国际品牌能更好的与国内科研领袖开展学术合作,可以提供更好的服务,对客户需求反应更迅速,技术支持方面更能满足国内客户的需要。

  郭枫:国产数字PCR生产产业链非常成熟,性能优越的数字PCR会和进口产品同等竞争!

  数字PCR市场还在发展早期,市场规模还很小,虽然市面上可用的产品主要是进口产品,其实远未形成真正的垄断。

  数字PCR仪器研发生产所需要的人才、微纳加工工艺、制造业产业链、软件算法开发和应用开发等资源,国内已经非常成熟且处于全球领先地位,所以国产数字PCR仪器的性能已经达到或超越国外产品。而且国产数字PCR企业可以提供更高性价比的产品、更高效的配套服务。未来的数字PCR市场一定是国产和进口产品同等竞争的局面。只要国内企业做好口碑,最终的数字PCR市场将是国产产品为主。
日期: 2019-04-24
 
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