在使用生物安全柜时，常常会有几大误区。比如，洁净工作台代替生物安全柜。在使用过程中，很多操作人员认为生物安全柜和洁净工作台外形相同，作用大同小异。其实，二者有本质差别。
洁净工作台是将通过高效过滤器的净化空气向下吹过工作区，用来保护样品，而由于工作区是正压区，气流通过操作窗口外溢，只保护样品，对操作人员和环境不提供保护。
生物安全柜则是一种负压净化工作台，可以防止操作者和环境暴露于实验室过程中产生的有害气溶胶，是传染性微生物的牢笼。正确地操作生物安全柜，能够完全保护操作人员、样品、工作环境。
不过，有了生物安全柜并不代表就万事大吉了，这其实是一种错误的观念。当操作失误或发生泄漏、破损时，生物安全柜并不能够保护操作者。
“生物安全柜前的空气幕很脆弱，极易受到干扰而造成污染。”有专家表示，实验中不能随意开启前窗的位置，操作动作不能缓和，手臂也要避免频繁出入安全柜，以防止打扰气流。
不仅如此，操作人员还要树立安全意识，养成良好的操作习惯，杜绝违规操作，并且严格遵照微生物学标准操作规程和生物安全实验室操作规程，使用规范的实验器材。
业内表示，目前，大多数用户对生物安全柜的检测性能不够了解，不少用户认为只要生物安全柜能转，就一直用下去，这其实成为了很大的隐患。
其实，生物安全柜在安装完毕、移动位置后、检修后，更换高效过滤器后都必须进行现场的重新检测。另外，用户还要进行一年一度的常规检查及安全评估。
为更加安全地使用生物安全柜，有专家建议，所有物品离前窗至少2英寸，如果有污染性的操作要尽量远离工作区域的后部;干净的物品要与污染的物品分开放置;污染的物品尽量放置在工作区域的后部。
需要注意的是，用户在操作时，物品和手臂都不要穿过前窗;还要避免使用明火，用适当的灭菌措施，避免使用干扰安全柜内层流的实验手段;安全柜处于操作状态时，要彻底消毒内壁。
除此之外，用户也要做好日维护、周维护、月维护、年维护的工作。例如，在日维护和周维护方面，要用柔性的清洁剂或玻璃专用清洁剂清洗箱体外表面和玻璃（如果安装了紫外灯也要对其进行清洁）。
在月维护上，要对设备进行功能检验，并在通常使用时检查设备的安全;在年维护上，建议用户每一年更换一次紫外灯，日光灯则要每两年更换一次。