发展到今天，电子显微镜的放大倍率已经可以超过1500万倍，就这一方面来说已经远超光学显微镜。但是，电子显微镜对于工作环境的真空要求非常高，并且电子束的照射也会使生物样品受到辐照损伤，并不适用与活体生物有关的研究。加上成本以及一些细枝末节的问题，让电子显微镜并不能替代光学显微镜的地位。
事实上，显微镜的发展离不开生物研究的发展。对于显微镜的贡献其实就是其通过显微镜的帮助，描述了许多肉眼所看不见的微小植物和动物。不仅如此，显微镜的出现让人们意识到微观世界中存在许多未知的同时，也开启了人们深入探索的激情。于是随着生物研究的深入，一方面显微镜分辨率开始飞速发展，另一方面为了满足实际观察时候的特殊需求荧光显微镜、解剖显微镜等具有特别特点的显微镜也开始逐渐发展起来。
但是，随着显微镜种类的逐渐复杂化，我国的显微镜产业也不得不面对技术性难题，面对海外的技术封锁，以及部分企业的进口产品依赖性，我国的显微镜在部分领域发展速度实数缓慢。
好在近年来相关的科研项目为我国显微镜产业的发展提供了一定的助力已发展方向，以文章开头提到的自主研发高端超分辨光学显微镜为例，这项具有原创性的成果不但为当今生物学和基础医学研究领域提供了重要的技术手段，一定程度上，在国际舞台打响了中国制造。据了解，中科院苏州医工所研制的超分辨显微镜或核心部件已在美国、德国、以色列及国内多家研究机构投入使用并取得部分成果。
相信，随着研究的深入，在求知欲与技术发展的共同作用想，显微镜的发展会越来越好，在人们解锁微观世界的秘密上，提供更多的帮助。