在学校全面布局的同时，还积极承担科技部、教育部、卫健委、基金委和北京市的抗疫应急科研任务。清华大学共承担各类应急项目11项。（科技部定向应急专项项目1项，教育部应急重点项目2项，卫健委应急专项1项，基金委应急专项1项，北京市应急专项5项，工程院委托 “新型冠状病毒传播与环境的关系及风险防控”专项。）
在学校的全面布局和全力推动下，抗疫科研攻关取得了一系列的重要成果，部分成果已经成功应用到抗疫一线。
程京院士团队研发的核酸试剂盒在1.5小时内可以对包括新冠病毒在内的6种呼吸道病毒进行检测，已经具备2万人份/每天的产能。并与2月26日捐赠给武汉抗疫4家医院核酸试剂盒共计1.2万人份。
林波荣教授团队研发的“高精度室内环境在线监测和预警系统”用于监测重点诊疗空间的环境安全，已经成功在火神山医院、雷神山医院和5个方舱医院部署200套，进行环境安全的监测和预警。
董家鸿院士牵头研发的“清华COVID-19智能防控系统”，包括：居民个人自测评估、社区疫情智能防控、智能分诊、智能诊断、远程多学科协同诊疗、无线生命体征监测、隔离病房巡诊机器人、可穿戴体温及心电监测系统共8项智能技术产品。2月23日，接到国务院应对新型冠状病毒肺炎联防联控机制医疗救治组的通知，由清华大学联合中国医师协会组成远程医疗队，由董家鸿院士率领6名专家组成的医疗队前往湖北武汉，向武汉捐赠了“清华COVID-19智能防控系统”，在武汉的8家定点医院、1家方舱医院和72个隔离区进行了部署，为全方位的疫情防控提供有效的支撑。例如，系统中的个人自测评估系统有5种语言的版本，已经在全球70多个国家得到应用，超过2000万人使用了该评估系统；智能诊断系统已经用于4万多病患的精确诊断；隔离区疫情信息系统，服务整个湖北490个隔离区，服务病患人群超过2万人。
由范维澄院士领衔的公共安全研究院团队研发的疫情态势分析与防控监管系统从疫情开始就全面支持了中国疾控中心的工作，用在了包括武汉市、北京市、广东省在内的20多个省市的政府指挥调度中。
清华大学和全球健康药物研发中心还向全球科研人员免费开放药物研发的资源和平台，共同加速针对新型冠状病毒的药物研发。
此外，清华大学智库机构的近百位专家学者围绕疫情风险评估和应对策略、突发公共卫生事件应急管理、完善相关法律法规体系、有序推动复工生产等方面为国家提供政策建议70余篇。
邓宁说，3月2日下午，习近平总书记在视察清华大学时对清华大学的抗疫科研攻关提出了希望和要求，按照总书记提出的七个方面的要求，在前期科研攻关基础上，组织研究梳理学校有优良基础的抗疫相关成果，整合优势学科，务求解决国家抗疫迫切需求、痛点问题，从诊断、治疗、防控、善后四个环节部署组织了8个抗疫科技攻关突击队，集中全校资源和力量全力保障科研攻关突击队的工作。
八个抗疫科技攻关突击队分别是：病患预防检测及确诊检测技术、超敏定量PCR试剂盒技术、抗体药物及疫苗、室内及楼宇空气杀毒技术、基于蛋白的病毒传播阻断剂、干细胞炎症治疗药物、流行病学研究和心理康复系统。
科研攻关突击队经过1个月的全力攻关，取得了一系列新的令人振奋的重大进展。
张林琦团队研发的拥有自主知识产权病毒载体的腺病毒疫苗和mRNA单克隆抗体药物取得重要进展。已成功分离出200余株具有高效中和能力的抗新冠病毒单克隆抗体及其编码基因。在科技部、教育部和北京市的支持和帮助下，团队已启动了与腾盛博药、药明康德的联合攻关，打通了研发、试验、生产的全链条，5月底疫苗和抗体药物均可进入动物安全性和有效性试验阶段。
程京院士团队联合博奥集团在现有试剂盒产品的基础上进一步优化检测技术，提高检测效率，并计划向德国捐赠试剂盒和检测设备。罗海云团队研发的新冠病毒杀查一体空气消毒系统可以高效快速可靠地杀灭空气中的新冠病毒，快速杀毒效果高于99.9%，近期可用于武汉隔离病房的消毒。
刘辛军团队研发的 “荼与”体温自动筛查机器人，室外测温精确度达到0.2摄氏度，可以对行人和车辆乘坐人员进行快速测温。目前正在开展实地测试。
郭永团队研发的超敏定量检测试剂盒已经完成了药监局审查前所有试验，并已具备量产能力。常智杰团队研发的干细胞治疗药物已开始有效性试验，并研发成功量产制造工艺，预计5月底开展临床研究。
按照习近平总书记疫情防控平战结合的指示，清华大学将发挥学科优势和人才优势，服务国家公共卫生体系的优化和完善。例如，通过以大数据和人工智能为主的信息技术手段，建立流行病长期准确预报的能力和预警机制，服务于国家疫情预报体系；再比如，要推动建设一个协同高效的疫苗药物研发平台和体系，提升我国在疫苗和药物方面的创新研发和产业化能力。