学术科研
武汉“火眼”实验室助力新型冠状病毒核酸检测
时间:2020-02-07 10:32  浏览:270
  近期,新型冠状病毒在多地蔓延,随着疫情的爆发,病毒核酸检测在疫情防控中发挥着突出作用,待检测的人数众多,检测人员的工作量巨大。为了解决大量的核酸检测问题,华大基因完成实验室设计,中交二航局于1月31日正式启动实验室施工,在中交二航局和上海诺瑞的279名员工全力奋战下,仅用5天时间建立了——武汉“火眼”实验室。
 
  核酸是所有生物分子中最重要的物质,广泛存在于所有动植物细胞、微生物体内。核酸是由许多核苷酸单体聚合成的生物大分子化合物,为生命的最基本物质之一。病毒核酸检测可直击新型冠状病毒的RNA或DNA结构,检测血液中是否存在病毒核酸,诊断有无病原体感染。病毒核酸检测在疫情防控中发挥着突出作用。
 
  采用核酸检测盒,样本从采集到检测需要经过灭活、核酸提取、试剂反应等多个过程。一例送到实验室的样本平均经过4-6个小时可以获得检测结果。
 
病毒核酸检测
 
  为了解决大量的核酸检测问题,华大基因完成实验室设计,中交二航局于1月31日正式启动实验室施工,在中交二航局和上海诺瑞的279名员工全力奋战下,仅用5天时间建立了——武汉“火眼”实验室。
 
  按照生物安全二级实验室设计,装备华大智造高通量测序整体解决方案和设备;30台B2级生物安全柜;自动化核酸提取平台配置12台自动化提取设备;还有实验室隔间、样本间、试剂保存间、办公区等。2020年2月5日,“火眼”实验室启动试运行。每日可检测万人份样本的新型冠状病毒应急检测,极大的提升了核酸检测效率。
 
  批量自动化核酸提取平台
 
  属于核酸提取领域,具体为一种通用自动化核酸提取平台。该平台有两个功能设备组成:液体工作站与核酸提取仪。液体工作站用于样品、试剂添加,核酸提取仪用于核酸提取,由软件控制实现核酸提取全制动化。设有6个功能区:样品区、耗材区、试剂区、中转区、核酸提取区、废弃区、其中优选是核酸提取区设有核酸提取装置kingFisher Flex,由软件程序控制完成样品的扫描、试剂样品加入中转区反应池、反应池转入核酸提取区进行核酸提取、PCR反应液配制、加核酸提取物等操作。提升了核酸提取的效率,软件能够与实验信息化管理系统交互数据,实现实验室管理标准化。
 
自动化核酸提取平台
  
       生物安全等级
 
  生物安全是人类生物危害的定义为生物性的传染媒介通过直接感染或间接破坏环境而导致对人类、动物或者植物的真实或者潜在的危险。“实验室生物安全”一词用来描述那些用以防止发生病原体或毒素无意中暴露及意外释放的防护原则、技术以及实践。生物安全等级是针对生物危害的不同程度而确定的,其中包括对实验人员、实验室,乃至环境保护的要求,通常按生物危害等级将微生物和生物医学实验室的安全相应划分为4级,以适应科研、教学、临床和诊断等各种适应的需要。
 
  实验室安全等级
 
  世界通用生物安全水平标准是由美国疾病控制中心(CDC)和美国国家卫生研究院(NIH)建立的。根据操
 
  作不同危险度等级微生物所需的实验室设计特点、建筑构造、防护设施、仪器、操作以及操作程序,实验室的生物安全水平可以分为基础实验室-一级生物安全水平、基础实验室-二级生物安全水平、防护实验室-三级生物安全水平和最高防护实验室-四级生物安全水平。
 
  微生物危险度等级
 
  生物安全等级通常可安全进行相关研究工作的条件的整合,与不同工作中的生物安全要求相匹配。控制生物安全风险的根本措施,就是根据生物安全评估结果,为所要开展的工作设定相应的生物安全等级。各实验室的生物安全级别根据物理控制水平所对应的能够在内安全操作的微生物危险度等级(1级~4级)确定,国际上以BSL一1、BSL一2、BSL一3、BSL一4。
 
  1、BSL-1代表病原体:麻疹病毒、腮腺炎病毒
 
  2、BSL-2代表病原体:流感病毒
 
  3、BSL-3代表病原体:炭疽芽孢杆菌、鼠疫杆菌、结核分枝杆菌、狂犬病毒
 
  4、BSL-4代表病原体:埃博拉病毒、马尔堡病毒、拉沙病毒
 
  生物安全柜
 
  是能防止实验操作处理过程中某些含有危险性或未知性生物微粒发生气溶胶散逸的箱型空气净化负压安全装置。其广泛应用于微生物学、生物医学、基因工程、生物制品等领域的科研、教学、临床检验和生产中,是实验室生物安全中一级防护屏障中最基本的安全防护设备。将柜内空气向外抽吸,使柜内保持负压状态,通过垂直气流来保护工作人员;外界空气经高效空气过滤器过滤后进入安全柜内,以避免处理样品被污染;柜内的空气也需经过HEPA过滤器过滤后再排放到大气中,以保护环境。生物安全柜一般由箱体和支架两部分组成。箱体部分主要包括空气过滤系统、外排风箱系统、动前窗驱动系统、电源、紫外灯、照明灯、风机开关、控制前玻璃门移动等装置。
 
  生物安全柜的分级
 
  按照NSF49标准,生物安全等级1级(P1)的媒质是指普通无害细菌、病毒等微生物;生物安全等级2级(P2)的媒质是指一般性可致病细菌、病毒等微生物;生物安全等级3级(P3)的媒质是指烈性/致命细菌、病毒等微生物,但感染后可治愈;生物安全等级4级(P4)的媒质是指烈性/致命细菌、病毒等微生物,感染后不易治愈。此标准将生物安全柜分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级,可适用于不同生物安全等级媒质的操作。
 
  一级生物安全柜本身无风机,依赖外接通风管中的风机带动气流,由于不能保护柜内产品,已较少使用。
 
  二级生物安全柜是应用最为广泛的柜型。按照NSF49的中的规定,二级生物安全柜依照入口气流风速、排气方式和循环方式可分为4个级别:A1型,A2型(原B3型),B1型和B2型。所有的二级生物安全柜都可提供工作人员、环境和产品的保护。
 
  三级生物安全柜是为3-4级实验室生物安全等级而设计的,柜体完全气密,工作人员通过连接在柜体的手套进行操作,俗称手套箱(Glove box),试验品通过双门的传递箱进出安全柜以确保不受污染,适用于高风险的生物试验。
 
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