今天你做的是抗原还是核酸?
相信这句话最近常常出现在上海小伙伴们微信聊天中。在本轮新冠疫情中,抗原检测作为核酸检测的补充手段被使用。那么大家知道新冠检测还有哪些方法吗?每种方法有什么区别?为什么需要频繁的进行抗原检测?
要回答以上问题,
我们先来简单看看新冠病毒的结构吧!
来源:Blake Oberfeld et al. SnapShot:COVID-19. Cell(2020).
简单来说,如图示从外到内观察, 在其最外层主要有3种蛋白,分别是:Spike (S) glycoprotein 刺突糖蛋白、Envelope ( viral envelope E) protein 膜糖蛋白(E-蛋白)、Matrix (M) glycoprotein 小包膜糖蛋白(M 蛋白)。其次病毒内核为:Helical nucleocapsid(N) protein 螺旋核衣壳蛋白,简称N蛋白。最 后为基因组,含有一条正向单链RNA(+ssRNA),为新冠病毒的遗传物质。
新冠检测主要有哪些方式?
目前主要的新冠检测有三种方式:抗体检测、抗原检测、核酸检测。
抗体检测:通过胶体金免疫层析和磁微粒化学发光检测由于病毒感染体内产生的IgM和IgG抗体。
抗原检测:通过胶体金免疫层析、乳胶法、荧光免疫层析检测新冠病毒蛋白。
核酸检测:通过实时荧光定量RT-PCR技术,检测病毒RNA。
核酸检测、抗原检测、抗体检测有什么区别?
首先三种方法检测的时期不同。
抗原检测一般在感染的第3-7天比较灵敏,更适合处于发病第 一周的患者进行检测。
新冠病毒核酸最 早可在症状出现前6天检测到,在症状出现时或几天后达到峰值。
新冠感染后,IgM和IgG抗体在症状出现后第11~14天达到峰值,而且IgM和IgG抗体往往几乎同时出现。因此抗体检测一般是在症状出现的两周后。
其次,三者的敏感性也不同。核酸检测敏感性比抗原和抗体检测敏感性更高,可检测到低病毒载量。
再者,检测样本也有差异。核酸检测和抗原检测通常需要采集鼻咽拭子或鼻拭子,而抗体检测需要用到血液样本。
除此之外,核酸检测对检测设备、人员均有较高的要求,得到结果的时间也较长,目前较快的新冠核酸检测的结果可以在4-6小时内得到。而抗原和抗体检测只需要15分钟就可以得到结果,操作也更简便。
核酸检测的假阴性又是怎么造成的?
首先,采样手法/技巧、采样深度控制等都会影响样本中病毒含量,如果含量过低就会出现假阴性结果。
其次是检测过程,核酸检测是基于实时荧光定量PCR的方式,若在检测中引入外源RNA酶和PCR抑 制剂等生物污染物,会直接导致病毒RNA分解及PCR反应无法进行,造成假阴性。
RNA酶和PCR抑 制剂影响RT-PCR过程
RNA酶和PCR抑 制剂的存在为什么会造成假阴性呢?我们先来看一下RT-PCR的过程:
1. 逆转录(RT):病毒单链RNA逆转录为单链cDNA(互补DNA);
2. 聚合酶链式反应(PCR):单链cDNA通过DNA聚合酶合成双链cDNA(ds cDNA),然后指数级扩增。
*扭扭脖子,横屏查看哦!
对于依赖RNA浓度水平的诊断测试,如果外源引入RNA酶和PCR抑 制剂:
• RNA酶:单链RNA不稳定,在痕量RNA酶存在时非常容易降解;RNA酶即使痕量也能在实验室环境中造成极大破坏。若检测中引入外源RNA酶,样本中的病毒RNA会被降解,模板浓度降低,导致假阴性。
• RCR抑 制剂:能够抑 制PCR扩增反应的物质,导致扩增效率低。若检测中引入PCR抑 制剂,PCR反应无法正常进行,导致假阴性。
BioClean Ultra™ 测试
瑞宁(RAININ) BioClean Ultra系列吸头产品,执行行业最严格且可验证的测试方法来检测生物污染物,包括RNA酶和PCR抑 制剂,且方法公开。RAININ通过定量PCR (qPCR) 测试吸头是否存在可能降低RT-PCR保真性的污染物。
许多其他品牌制造商虽然也声明无生物污染物,但并不完整:
▶ 只标明 “不含RNA酶”,但未提供任何公开测试方法和检测限,在缺少任何指定检测限(LOD)的情况下,无法得出有关测试可靠性的任何结论;
▶ 测试结果不完整:
▶ 如只列出“KU” 或 “飞克”,但不说明该污染物的具体情况或范围;不对PCR抑 制剂进行检测。(KU=Kunitz Units; 飞克
因此,新冠病毒COVID-19的检测请信任瑞宁(RAININ) 吸头产品。
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