原理：
Ø酶谱法的基本过程是先将样品进行SDS-聚丙烯酰胺（SDS-PAGE，含0.1％明胶）电泳分离，然后在有二价金属离子存在的缓冲系统中使样品中的MMP-2和MMP-9恢复活性，在各自的迁移位置水解凝胶里的明胶，最后用考马斯亮蓝将凝胶染色，再脱色，在蓝色背景下可出现白色条带，条带的强弱与MMP-2和MMP-9活性成正比。
复性原理：在电泳过程中，SDS与样品中的MMPs结合（当然是可逆性结合），破坏其氢键、疏水键而使MMPs不能发挥其分解明胶的作用，而只有当将胶置Trition中洗脱（最好是放在摇床上摇，30min／次，做2次或15min/次，4次。静置于Trition中是不妥的。）时，由于SDS被Trition结合而去除，从而使MMPs恢复了活性。
试剂的配制
（1）配制10%SDS聚丙烯酰胺凝胶（含1.0mg/ml明胶，配好后1周内使用，明胶含量低灵敏度高）
A．分离胶的配制（注：根据你所用的电泳仪胶的大小确定配制胶的量）
10%SDS聚丙烯酰胺凝胶10ml（包括）
ddH2O4.5ml
30%储备胶（0.8%BIS+29.2%丙烯酰胺）2ml
1.5mol/lTris（PH8.8）2.5ml
10%SDS100ul
10%过硫酸铵（APS）100ul
TEMED8ul
1%明胶（1g明胶-->100ml，37°C水浴溶解）0.5ml
B.浓缩胶的配制
浓缩胶6ml
ddH2O4.5ml
30%储备胶0.75ml
1mol/lTris-HCL(PH6.8)0.76ml
10%SDS60ul
10%过硫酸铵60ul
TEMED6ul
（3）5×Tris�甘氨酸电极缓冲液
0.125mol/lTris-HCL，1.25mol/l甘氨酸，0.5%SDS（PH8.3）
（4）4×上样缓冲液
0.32%Tris-HCL6.4ml
4%SDS（PH7.2）8ml
16%甘油3.2ml
溴酚蓝0.024g
ddH2O2.4ml
(5)洗脱液:2.5%TritonX-100，50mmol/LTris-HCl<6.057g/L>，5mmol/LCaCl2<0.5549g/L>，pH7.6（40分钟两次，中间换液）
（6）漂洗液：50mmol/LTris-HCl，5mmol/LCaCl2，pH7.6（20分钟2次）
（7）孵育液：50mmol/LTris,pH7.5,150mmol/LNaCl,10mmol/LCaCl2,0.02%NaN3（孵育42小时）
（8）染色液：0.05%Coomassic亮蓝R-250，30%甲醇，10%乙酸（染色3小时）
（9）脱色液A、B、C：甲醇浓度分别为30%、20%、10%,乙酸浓度分别为10%、10%、5%（分别30min、1h、2h脱色）
实验步骤
1.取对数期的癌细胞在的无血清培养基DMEM中培养24h。
2.次日收集上清液，将上清液移入离心管中2000rpm离心10min，-70℃储存备用。
3.根据细胞计数调整各组细胞培养上清液中的蛋白浓度（或者测定蛋白浓度调整使所上蛋白总量一致）。与5×上样缓冲液混合，13ul样本+4ul上样缓冲液。（不要用枪用力吹打，防止出现过多气泡）
4.配制分离胶和浓缩胶，16ul/孔上样（根据表达强度和蛋白浓度确定上样量），4℃进行SDS-PAGE电泳100v约1.5小时（电泳时在周围敷上冰，有利于使条带跑直）。
5.电泳结束后,将凝胶置于洗脱液(2.5%TritonX-100，50mmol/LTris-HCl，5mmol/LCaCl2，pH7.6)中振荡洗脱2次,每次40分钟,然后用漂洗液(除不含TritonX-100外其余同洗脱液)漂洗2次,每次20分钟,接着,将凝胶置于孵育液(50mmol/LTris-HCl,5mmol/CaCl2,0.02%Brij-35,pH7.6)中37℃孵育42h。
6.孵育结束后经染色液(0.05%Coomassic亮蓝、30%甲醇、10%乙酸)染色3h,及脱色液A、B、C(甲醇浓度分别为30%、20%、10%,乙酸浓度分别为10%、10%、5%)分别脱色0.5、1、2h后，显示出MMP-2（72KD）和MMP-9（92KD）为位于蓝色背景上的透亮带，用凝胶图像分析系统分析读取条带面积，宽度和灰度值，做统计分析。
注意事项：
1.制备聚丙烯酰胺时应注意排除气泡。
2.明胶酶谱的活性受钙离子，锌离子，和PH值等因素的影响，因此缓冲液配制应严格准确，尽量用超纯水，孵育温度也掌握好。
3.用大梳子
4.孵育液的PH最好在7.5-7.6，复性的TRITON时间长了会有絮状物，所以实验时尽量使用新鲜配置的。
5.孵育的37度不要在CO2培养箱中，因为会改变孵育液的PH值，在普通孵箱即可。
6.明胶要4度保存，配好后1周内使用
凝胶制备：
1.玻璃板对齐后放入夹中，垂直卡紧，加满水检漏。
2.配10%分离胶，APS和TEMED作用为促凝，最后灌胶前加。若板不漏水，则将水倒出，并用吸水纸洗净后灌胶，灌至大约3/4处，上面加满水压平。
3.配浓缩胶，同样地，APS和TEMED最后加，分离胶灌入约30min后观察小烧杯中剩余分离胶是否已凝，同时仔细观察可见玻板水和胶间有一条折线，说明胶已凝固。
4.将上面的水倒去，吸水纸洗净，灌入浓缩胶，灌满，注意一定不要有气泡，然后将梳子插入，注意保持水平，约30min后凝固可用。
5.拔梳子在电泳缓冲液中拔，加样孔用小针筒冲洗干净再上样，注意上样时勿使样品逸至邻孔，样品混匀时要轻，不要产生气泡，否则加样时易导致逸出而使结果不准确。