异硫氰酸胍—酚法提取RNA的原理如下：GIT与β－巯基乙醇共同作用抑制RNase的活性；GIT与十二烷基肌氨酸钠（Sarcosyl）作用使蛋白质变性，从而释放RNA；酸性条件下DNA极少发生解离，同蛋白质一起变性被离心下来，RNA则溶于上清中。该法所提RNA纯度高完整性好较适合纯化mRNA，逆转录及构建cDNA文库，因此为大多数人采用。与氯化铯方法比较，虽然纯度稍差一些，小分子RNA，如tRNA、snRNA不易去除，但产量高完整性好，盐易去除。
一、材料、试剂和仪器
1材料植物组织（根或叶）
2试剂
1）异硫氰酸胍溶液：4mol/L异硫氰酸胍（GIT），25mmol/L柠檬酸钠（pH7.0）,0.5%十二烷基肌氨酸钠（Sarcosyl）,0.1Mβ－巯基乙醇（用时再加，0.36mL/50mL体系）
2）2mol/LNaAc（pH4.0）:用醋酸配，加少量水调pH。
3）水饱和酚（pH3.5）
4）氯仿/异戊醇（CI）（24：1）
5）异丙醇(－20℃存放)
6）DEPC－H2O（0.1%，V/V）
3仪器:冰冻离心机，研钵
二、实验程序
1大量提取
1）取植物组织5g加入液氮充分研磨，转到一支预冷50mL的离心管中，顺序加入：15mL异硫氰酸胍溶液，1.5mL2MNaAc（pH4.0）,15mL水饱和酚和3mL氯仿/异戊醇。混匀后置冰上15min。
2）4℃，15000g离心30min转上清于另一管中，加等体积异丙醇，混匀－20℃沉淀1hr.。
3）4℃，15000g离心25min，弃去上清，加5mL异硫氰酸胍溶液溶解沉淀后再加异丙醇—20℃沉淀1hr。离心收集RNA沉淀，70％乙醇洗一次后晾干，加500μlDEPC处理的水溶RNA。取5μl电泳检测完整性，取5μl测紫外吸收值检测纯度及浓度。
2小量提取
1）取2g左右植物组织放入研钵中，反复加入液氮充分研磨至粉末状。加4－5mL异硫氰酸胍溶液。转移到小离心管中，每管0.5mL。
2）置于冰上，顺序加入：50μl2mol/LNaAc,混匀，0.5mL水饱和酚，170μlCI，混匀。置冰上15min。
3）各管平衡后，4℃,12000g离心20-30min。转移上清到另一管中，加入等体积的异丙醇，混匀，－20℃沉淀30min-1hr或－80℃沉淀10min。4℃,12000g离心20min回收RNA。
4）用70％乙醇洗一次，4℃，12000g离心5min。吸去乙醇，空气中吹干RNA沉淀。用150μl异硫氰酸胍溶液，65℃吹打RNA沉淀溶解。
5）加等体积异丙醇－20℃沉淀30min-1hr或－80℃沉淀10min。4℃,12000g离心20min回收RNA。
6）用70％乙醇洗两次后，吹干溶于适量的DEPC－H2O中。部分分装后进行纯度及完整性的检测。其余加2.5倍体积乙醇沉淀于－80℃冰箱中存放。
7）紫外分光光度分析纯度和含量，甲醛变性琼脂糖凝胶电泳分析完整性。