2、实验分析开始前和结束后，使用甲醇冲洗整个液体流路，避免水或腐蚀性溶剂滞留泵中。
3、配备泵密封垫、单向阀、泵头、各式接头、保险丝等配件，定期检查更换，并补充润滑油。
4、高压泵避免长时间高压工作。如果发现泵的工作压力过高，应立即停止运行，查清故障。通常色谱柱、管路、过滤器等出现堵塞，或输液流量太大时，都会导致泵的工作压力过高。
5、更换流动相时，若与之前流动相互溶，可打开排液阀以10ml/min的流速排出先前的流动相，然后关闭排液阀，将新流动相以1.0ml/min的流速清洗流路；若两种流动相不相溶，则需要用一种与新、旧流动相互溶的溶剂进行过渡清洗。
6、使用过程中经常观察泵的运行状态，及时发现并解决问题。