1、流速设定过高。
将流速调整到适当数值。
2、流动相使用不当或缓冲盐的结晶沉淀。
更换流动相，冲洗色谱柱。
3、柱前筛板堵塞。
在允许情况下反冲色谱柱，更换筛板，更换色谱柱。
4、保护柱堵塞。
清洗或更换保护柱。
二、压力持续偏低
1、流速设定过低。
将流速适当调高。
2、系统漏液。
检查色谱柱接口、泵等位置，确定漏液位置并维修。
3、色谱柱选择不当。
更换合适的色谱柱。
三、压力波动较大
1、管道中有气体，流动相脱气不充分。
流动相继续脱气或改变脱气方法（如在线脱气等）。
2、单向阀、泵密封损坏。
更换单向阀和泵。
3、流动相粘度变化引起压力波动。
改用溶剂梯度洗脱。
四、漏液
通常可以通过拧紧或更换管路接头来解决漏液的问题。但值得注意的是过份拧紧会导致金属接头的漏液和塑料接头的磨损。如果通过稍微拧紧接头不能解决漏液的问题，就必须将接头取下，检查是否损坏（例如，卡套损坏、密封表面有杂质）；损坏的接头应该更换掉。
1、接头处漏液。
一般通过拧紧、清洗、更换等方法即可解决。
2、泵漏液。
检查单向阀、接头是否松动，若松动拧紧（不要太紧）即可；检查混合器和泵的密封是否损坏；
3、进样阀漏液。
检查进样阀转子、密封口是否松动，若松动则拧紧；检查废液管是否堵塞或产生虹吸现象，疏通或更换废液管，保持废液管高于废液液面。
4、色谱柱漏液。
尾端接头松动，拧紧接头；卡套内有填料，拆下卡套，清洗卡套，重新安装；筛板厚度不合适，更换合适的筛板。
5、检测器漏液。
检查流通池垫片、窗口是否损坏，更换垫片或窗口；检查流通池是否阻塞，更换或者重新安装；检查废液管是否阻塞，更换废液管。