等电聚焦电泳色谱仪是利用蛋白质分子或其它两性分子的等电点不同，在一个稳定、连续和线性的pH梯度中进行分离，检测方法有染色法、扫描法和其它检测方法。

　　一、染色法：

　　1、考马斯亮蓝染色法。

　　2、银染色法。

　　3、同工酶染色法。

　　4、专一蛋白染色法。

　　5、荧光标记以及免疫法。

　　二、扫描法：

　　激光光源强度大，单色性好，扫描IEFE区带合适。

　　操作程序和条件必须严格相同。

　　三、其它检测方法：

　　1、电泳转移法。

　　2、双向电泳法。

　　3、滴定曲线分析法。