气相色谱仪是一种常用的分析器，被广发用于化工、生物化学、医药卫生等领域中。气象色谱与其他器一样在使用中会产生一定的故障问题，对于用户的使用会造成影响。
　　一、进样后不出色谱峰的故障
　　气相色谱仪在进样后检测信号没有变化，不出峰，输出仍为直线。遇到这种情况时，应按从样品进样针、进样口到检测器的顺序逐一检查。
　　1、首先检查注射器是否堵塞，如果没有问题，
　　2、再检查进样口和检测器的石墨垫圈是否紧固、不漏气，
　　3、然后检查色谱柱是否有断裂漏气情况，
　　4、观察检测器出口是否畅通。
　　5、检测器出口的畅通是很重要的，有人在工作中会遇到这样的问题：前一天器工作还一切正常，第二天开机后却无响应峰信号。检查进样口、注射器、垫圈和色谱柱都正常，可就是不出峰，无意中发现进样口柱头压达不到设定值，总是偏高，这时才怀疑是ECD检验器出口不畅通。由于ECD的排放物有一定的放射性，所以ECD出口是引到室外的。当时是秋冬之交，雨水进入到ECD排出口之后冻住了，因此造成器ECD的出口堵塞，柱头压居高不下，气体在气路中无法流动，也就无法载样品到检测器，所以不出峰。
　　二、基线问题
　　气相色谱仪基线波动、飘移都是基线问题，基线问题可使测量误差增大，有时甚至会导致器无法正常使用。
　　1、遇到基线问题时应先检查器条件是否有改变，近期是否新换气瓶及设备配件。
　　2、如果有更换或条件有改变，则要先检查基线问题是不是由这些改变造成的，一般来说，这种变化往往是产生基线问题的原因。有些人在工作中就遇到过这种情形：新载气纯度不够，换过载气之后，基线逐渐上升(由于载气净化管的原因，基线不是马上变化的)。第二天开机之后，基线非常高，并伴有基线强烈抖动，所有峰都湮没在噪音中，无法检测。经过检查，问题出现在新换的载气上，重新更换载气后，立即恢复了正常。
　　3、当排除了以上可能造成基线问题的原因后，则应当检查进样垫是否老化(应养成定期更换进样垫的好习惯);
　　4、石英棉是不是该更换了;
　　5、衬管是否清洁。值得一提的是，清洗衬管时可先用试验定容的溶剂充分浸泡，再用超声波清洗几分钟，然后放入高温炉中加热到比工作温度略高的温度，再重新安装。
　　6、此外，检测器污染也可能造成基线问题，其可以通过清洗或热清洗的方法来解决。