电泳槽时凝胶时间不对,那么通常胶在60min,1H内凝;
如果凝的太慢,可能是TEMEN,APS剂量不够或者失效。
APS应该现配现用,TEMED不稳定,容易被氧化成黄色。
如果凝的太快,可能是APS和TEMED用量过多,此时胶太硬易裂,电泳时易烧胶。
纹理和托尾现:
由于样品溶解不佳引起的,克服的方法可以在加样前离心,增加一些增溶辅助试剂如尿素。
蛋白带过宽,与邻近泳道的蛋白带相连时由于加样量太多,可以减少上样量。
电泳时间比正常要长。
可能由于凝胶缓冲系统和电极缓冲系统的PH选择错误,即缓冲系统的PH和被分离物质的等电点差别太小,或缓冲系统的离子强度太高。
指示剂成微笑符号(指示剂前沿呈现向上的曲线形),说明凝胶的不均匀冷却,中间部分冷却不好,导致分子有不同的迁移率所致。
指示剂成哭脸符号(指示剂前沿呈现向下的曲线形),由于电泳槽的装置不合适,尤其是凝胶和玻璃板组成的“三明治”底部有气泡或靠近隔片的凝胶聚合不完全。