在微生物检验操作过程中，要保证做样环境（如超净台、房间）以及所用工器具的洁净程度，同时保证人员各种操作的规范性，尽量保证其无菌性，防止因人为原因操作失误而出现误差结果，同时在适宜温度进行培养，为合理决策和指导生产提供依据。
为保证检测结果的准确性，我们应做好以下几个方面：
培养基的灭菌及使用
1.每次配置时，要注意其生产日期是否在保质期内，查看其开瓶日期及瓶口密封性，保证其未变质，并且未吸潮。
2.培养基配置时，称量要准确，包括盐水的分装要准确。
3.一定要保证现配制现灭菌，未灭菌的配好培养基不能长时间放置，更不可隔夜。
4.灭菌时要保证恒温、恒压，同时要保证有效灭菌时间。
5.灭菌过的培养基要冰箱保存，可保存一周，一般不超过3天。而且要遵循“先入先出”原则，先配制的要先使用。
6.在使用时，要根据当班次的使用量，用水浴锅先将培养基溶化为液态，然后及时调低水域温度（先化好的可从水域取出，放在水浴锅锅盖上）待用，千万不可长时间使培养基处于高温状态。
7.做产品微生物检测时，倾倒培养基温度在45℃左右，不可过烫，避免将菌烫死；也不可过凉，化好的培养基又结块凝固，不便于观察结果。
8.每瓶培养基均要做空白。
9.尽量集中做样，避免频繁打开同一瓶培养基瓶塞，增大培养基的污染几率，出现误差结果。
10.培养基剩余过少时，可先将其倾倒成空白用板。
做样环境的维持
一.大环境（房间）
1.做样时，窗户和空调要关闭，或用酒精对房间进行喷雾消毒，避免房间内空气流通影响超净台内部环境（最好在有通排风系统的恒温恒湿无菌间进行操作）。
2.如果在原来的原料微生物检测室进行做样，要定期开启紫外灯，对房间进行杀菌。
二.小环境（超净台）
1.定期清洁初效过滤器，要及时更换。
2.做样前，将超净台内部进行清洁，用75%酒精进行擦拭消毒，并提前半小时将超净台紫外灯打开，对超净台内部环境进行杀菌。
3.关紫外灯，开风机，调整合适进风量，风量不可过低。
4.每次做样后，要对超净台内部进行清理、清洁，并用75%酒精进行擦拭消毒。
5.紫外灯根据其使用寿命要及时更换。
6.做样同时，要做上相应菌落检测的环境空白。
7.做样区域的选择：
a、一般在距离超净台外沿的1/3-2/3区域进行无菌操作；
b、要在酒精灯火焰的外焰保护区域进行操作。
工器具的洁净度
1.玻璃器皿：采用干热灭菌方式进行灭菌。
2.做样用剪刀、勺子等物品要做到做样专用，不可与其它操作器具混用，使用时，先用75%酒精消毒，再采用灼烧方式进行灭菌。
3.接种针（环）采用灼烧方式进行灭菌，但要注意做样时要先将接种针（环）进行冷却。
样品的采集及检测
一.保证采样器具的无菌性
1）玻璃器皿：采用干热灭菌方式进行灭菌，保证恒温、时间足够（但不可时间过长，导致玻璃器皿易裂纹而报废）。
2）取样筐：使用前要用75%酒精进行喷洒消毒
3）取样勺、浓奶取样提子：要保证其清洁消毒，清洁后用75%酒精进行擦拭消毒。
4）取样袋：可现用酒精进行擦拭消毒，再在超净台用紫外灯照射消毒，（包装车间要在传递窗用紫外灯照射消毒）。
5）电子称表面用75%酒精消毒。
二.人员操作
1.保证手部的清洗、消毒：取样前及做样前都要先洗手再消毒。
2.取样要具有代表性（随机样、目的样、综合样）且要标示清楚。
3.取样完毕，不可在车间逗留，要及时将样品放入超净台，对其外表面进行紫外灯照射消毒。
4.在要求的做样区域进行操作。
5.做样前，要用75%酒精棉球对样品袋口部进行擦拭消毒，再开口。
6.往盐水瓶加样品时，要注意勺子或袋子尽量不接触瓶口。
7.样品计量要准确，稀释倍数也要准确（1mL吸管不允许将管口敲掉），进行100倍稀释时，1mL吸管要伸入盐水中，不可以将样品管壁流下去，同时要避免将管底部捅破。
8.盐水温度以40℃左右为宜，不能过热，将部分微生物烫死，也不能温度太低，不能将奶粉溶解完全。
9.进行稀释时，要摇匀，保证溶液的均一性。
10.倾倒平皿时，要注意培养基瓶口不要接触到平皿；倾倒的培养基要适量，不可以太少，在培养过程中干掉，微生物亦死亡，以15mL左右为宜。
11.做大肠菌群样时，要提前将乳糖胆盐培养基培养管按需要量备好，放入超净台对外表面进行紫外线灭菌。
12.接二步时，要注意先将接种针（环）进行冷却，避免出现接不上菌落的情况发生，导致无法判断、确认。
13.做样完毕，及时放入相应培养箱进行培养，并清理清洁超净台。
微生物的培养
1.在培养过程中，要随时监控培养箱温度，保证其在适宜的温度进行培养。
2.要按照《微生物检验规范》要求及时观察结果，出现异常，要及时分析原因进行反馈。