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反相还是正相，是根据流动相相对于固定相的极性而言的。 流动相极性强于固定相的，称作反相色谱；流动相极性弱于固定相的，称作正相色谱。反相色谱流动相的极性强，容易带着极性分子走，而留下非极性分子。这主要用于非极性样品的分离。常用的高压液相色谱都是这种，也有人喜欢说反相液相色谱，其实是一个意思，就是显得博学一点。正相色谱固定相极性强，容易把极性分子留下，故主要用于极性样品的分离。如离子色谱。实际应用好像没有太注意正相还是反相，倒是都很注意柱子能承受什么样极性的物质。反相液相色谱柱不可以用强极性的纯水，都是要加入至少5%的有机溶剂来弱化水的极性。 正相的离子色谱柱则坚决不可以进入有机物质。但是气相色谱实际也是一种正相色谱，却往往要求不可以有水进入。高效液相色谱的正相与反相区分方式如下：正相色谱：固定相极性大于流动相极性；反相色谱：固定相极性小于流动相极性。高效液相色谱法（High Performance Liquid Chromatography \ HPLC）又称“高压液相色谱”、“高速液相色谱”、“高分离度液相色谱”、“近代柱色谱”等。高效液相色谱是色谱法的一个重要分支，以液体为流动相，采用高压输液系统，将具有不同极性的单一溶剂或不同比例的混合溶剂、缓冲液等流动相泵入装有固定相的色谱柱，在柱内各成分被分离后，进入检测器进行检测，从而实现对试样的分析。该方法已成为化学、医学、工业、农学、商检和法检等学科领域中重要的分离分析技术。